Benito Juárez planeaba su reelección pero un infarto inesperado le provocó la muerte a la edad de 66 años. La muerte de Benito Juárez fue inesperada, De repente se quejó de un dolor fuerte en la zona del pecho que lo postró por solo unas cuantas horas, el médico que certificó su fallecimiento aseguró que fue por angina de pecho, el deceso se registró cerca de las 11 de la noche.
A su muerte, quien asumió la presidencia, de acuerdo a la Ley, fue Sebastián Lerdo de Tejada quien se desempeñaba como presidente de la Suprema Corte de Justicia y decretó tres días de duelo nacional.
El cuerpo de Benito Juárez fue expuesto durante tres días en el Salón de Embajadores de Palacio Nacional y el 23 de julio fue enterrado en el panteón de San Fernando con todos los honores.