La muerte de Benito Juárez fue inesperada, ya que de repente se quejó de un dolor fuerte en la zona del pecho que lo postraría por solo unas cuantas horas ya que muere por angina de pecho en Palacio Nacional, según sus biógrafos, cerca de las 11 de la noche.
A su muerte, quien asumió la presidencia, de acuerdo a la Ley, fue Sebastián Lerdo de Tejada quien se desempeñaba como presidente de la Suprema Corte de Justicia y decretó tres días de duelo nacional.
El cuerpo de Benito Juárez fue expuesto durante tres días en el Salón de Embajadores de Palacio Nacional y el 23 de julio fue enterrado en el panteón de San Fernando con todos los honores.